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Adaptation des micro-organismes et fonctionnement biogéochimique d'environnements aquatiques "primitifs" (extrêmes)

 

Nous étudions le fonctionnement biogéochimique de lacs de cratère contemporains qui constituent de potentiels analogues de la biosphère «primitive» (Figure). La prédominance des communautés procaryotes dans ces écosystèmes stratifiés (due à la présence de gradients redox prononcés, d'une anoxie prolongée des eaux de fond, de fortes teneurs en éléments dissous, etc.) en fait de véritables «laboratoires naturels de la vie microbienne en milieux extrêmes». En nous basant sur la composition moléculaire et isotopique de la matière organique dans la colonne d'eau et dans les sédiments anoxiques sous-jacents (http://lgltpe.ens-lyon.fr/news/carotte-a-mayotte)sur la diversité des communautés microbiennes (Archaea, Bacteria, Eukarya), et sur la spéciation de certaines espèces chimiques (e.g., soufre), nous caractérisons les modes de fonctionnement biogéochimique de ces écosystèmes hors du commun depuis leur formation (post-éruption volcanique) jusqu'à nos jours. En collaboration avec TOTAL E&P, nous essayons notamment de comprendre l’origine, le devenir diagénétique et la signature géochimique spécifique de la matière organique déposée et préservée dans ce genre d’environnements de dépôt, dont certains possèdent des points communs avec des roches mères pétrolières lacustres.

En collaboration avec des collègues (bio)chimistes et (micro)biologistes, nous étudions également la biosynthèse, par des microorganismes isolés du milieu naturel, de lipides d’intérêt biotechnologique et/ou environnemental (wax esters, éthers de glycérols, etc. ; Figure). Ces travaux sont notamment menés dans le cadre du projet ANR BAGEL (BActerial Glycerol Ether Lipids ; programme Blanc SVSE7 ; coordinateur V. Grossi).

Participants : Vincent Grossi (DR), Ingrid Antheaume (IE), Arnauld Vinçon-Laugier (doctorant 2013-2017; ATER 2017-2018), David Sala (doctorant 2015-2018), Ivan Jovovic (doctorant 2016-2019).